有经验的医生根据灰指甲的症状，再加上一项真菌学检查阳性很容易就能作出灰指甲的诊断。说起来容易做起来难，在灰指甲的检查过程中只要稍有疏忽就会造成误诊。所以，灰指甲的检查应当引起重视，除了较为常见的真菌直接镜检、真菌培养和甲组织病理学检查之外，还有一些非主流的新型的技术也能更好的帮助检查灰指甲。

辅助检查

取甲表面、甲下碎屑、甲组织进行真菌镜检常可发现真菌菌丝和孢子，可以协助诊断，但不能确定致病菌种；将上述组织置于培养基进行培养，经过2-4周，可分离出致病真菌，这样有利于制定治疗方案。病理检查发现菌丝和孢子时可确诊，为诊断甲真菌病的金标准，注意病病理时同时做真菌培养。

诊断与鉴别诊断

1、诊断 甲下型灰指甲由于其真菌量较少，且常位于甲板的比较下部，诊断较难。其他真菌性白甲及灰指甲从临床结合真菌检查容易诊断。

2、鉴别诊断 灰指甲应与许多甲病鉴别。甲病的原因多种多样，许多局部和全身性疾病都可引起甲板的改变。全身疾病的甲表现多同时累及多数或甲，如银屑病。局限性皮肤病如手部湿疹、甲沟炎、扁平苔藓引起的甲改变，甲板多仍有光泽，真菌检查可准确鉴别。